Hver frigjøring av spesialstyrker mot terrorisme har en sapper som er involvert i å designe forskjellige bomber. I dag i Defuse The Bomb: Secret Mission, vil du hjelpe en av dem. Før du på skjermen vises et tredimensjonalt bilde av eksplosiver. En timer vil vises over den, som måler tiden før eksplosjonen. Du må rotere sprengstoffene i rommet for å finne en klynge ledninger som kommer inn i sikringsenheten. Ved å kutte en viss ledning, stopper du tidtakeren og defuser bomben.