Den lille grønne verden kan forsvinne, og en ørken vil vises i stedet, fordi røde og blå ondskapsfulle mikroorganismer begynte å dukke opp overalt. De spiser alle levende ting og smitter med sykdommer. Det er nødvendig å ødelegge små skapninger før det er for sent. For å gjøre dette, spre den modige runde helten og knuse monstre. Men blå mikrober kan bare drepes ved å lade opp med makt fra en steinrune i samme farge, det samme må gjøres for å eliminere røde fiender, og det er en rune med samme farge for dette. Den blå ballen skal ikke berøre de røde mikrober, ellers vil den dø i Crazy Bounce Ball.
