Den modige ninja mottok en ordre fra mesteren om sin ordre om å gå til statsgrensen og speidere situasjonen i nærheten av en av byene. I følge ryktene var det monstre. Du i Ninja-spillet må hjelpe karakteren din med å gjøre denne intelligensen. Helten din vil rase langs veien langs en bestemt rute. Ganske ofte vil hindringer, bakkefeil og forskjellige typer feller komme over hans vei. Når karakteren din nærmer seg dem, må du klikke på skjermen med musen. Da vil helten din hoppe og fly over disse farlige områdene. Du må også samle forskjellige perler spredt overalt.
