Pikselverdenen slukket en grusom apokalypse. Innbyggerne er delt inn i flere leirer, som stadig kjemper blant seg selv. I tillegg var det zombier og mutanter som er klare til å fortære noen. Etter å ha kommet inn i Pixel Apocalypse: New Adventure spillet, er det første stedet du må velge et sted. Det kan allerede være ferdig, eller du vil lage det selv. Da må du velge din status. Du kan bli soldat og til og med zombier. Avhengig av dette vil dine evner bli stavet ut. De døde trenger ikke våpen, de beveger seg raskt og styrt av sine tenner og hender. Soldaten trenger et våpen, og du vil finne det eller kjøpe det når du tjener trofépenningen.
