I pikselverdenen, etter utslipp av kjemikalier på en av plantene, ble innbyggerne i nærmeste by omgjort til zombier. Du i spillet Pixel Apocalypse: Infection Begin må ta opp armer og prøve å komme seg ut av byen og samtidig redde andre mennesker. Etter deres død, prøv å hente trofeer som kan falle ut av monstre. Også nøye undersøke alt rundt og se etter våpen og ammunisjon.
