I spillet The Deep Puzzle, vil vi bli kjent med en gruppe forskere som undersøker dybden av havet. I dag har de en hviledag og at det er ubrukelig å ikke kaste bort tid, bestemte de seg for å bruke det på å spille et puslespill. Vi vil bli med deg i denne underholdningen. Før du kommer på skjermen, vil du se bilder av deres liv. Du velger en av dem. Etter det vil det splitte seg i mange deler. Deretter må du ta ett element og dra dem til spillefeltet. På denne måten samler du dette puslespillet og gjenoppretter bildene.