I den andre delen av spillet angriper Alien Mutants 2 vil du i spesialstyrker kjempe for en av de store byene i Amerika. Krigen av de mutante monstrene var i stand til å fange byen og jakter nå folk der. Din frigjøring mottok en ordre for å rydde gatene i byen fra monstre. Etter å ha landet fra helikopteret, vil helten din og hans tropp begynne å bevege seg gjennom byen. Flytte korte strekk bør du spore alt som skjer rundt og se etter fienden. Så snart du ser ham, begynn å skyte fra våpenet ditt og drep dem. Prøv å samle ammunisjon og førstehjelpssett. De vil hjelpe deg å overleve i kamp.
