Alle av oss har hørt legender om en slik mytisk skapning som Cthulhu. Og forestill deg at dette ikke er en myte og et sted høyt i fjellet han lever. I dag i spillet The Little Cthulhu vil vi hjelpe denne helten til å samle spesielle energiklubber som er spredt over hele verden. Du må fly over nattbyer og samle dem. Men på vei til vår helt vil det oppstå forskjellige bybygninger og andre gjenstander som han kan bli skadet i. Du kontrollerer flyet må gjøre det slik at det ikke skjer.