Nysgjerrige tenåringer Mabel og Dipper bor i Gravity Falls, og dette stedet er kjent for sine unormale fenomen, mystikk og mysterium er i hvert trinn. På loftet i det gamle huset fant barna en gammel dagbok, hvor det var mye interessant informasjon og spesielt de magiske runene. For deres søk gikk tegnene til fjellene. Velg helten: jenta vil klatre på fjellet, og gutten må hoppe på de bevegelige plattformene nedover. Behandle pilene, samle runene og få fortjente priser for å kunne vare så lenge som mulig. Vokt dere for store flaggermus i Gravity Falls Magic Rune Mystery.