Raven, Robin, Starfire, Cuborg og Beast Boy ser alle like ut i Teen Titans Go! : Ninjarun, fordi de hadde på seg ninjakostymer. Nå er det ganske vanskelig å skille de unge titanene fra hverandre. Men du trenger bare å klikke på den valgte helten og navnet hans vises nedenfor. På denne måten kan du velge hvilken som helst av de fem karakterene for videre handlinger. De representerer en løpetur langs en vei med hindringer, og for hver karakter vil de være individuelle og forskjellige fra de andre. Du må hjelpe helten med å omgå, hoppe og dukke i Teen Titans Go! : Ninjarun.