Romvesenets skip styrtet et sted i ørkenen på den fjerne og ukjente planeten Jorden. Romvesenet planla ikke å lande på planeten vår, men skipet hans mistet kontrollen etter en kollisjon med en meteoritt og styrtet. Piloten klarte å overleve, men fallet hans gikk ikke upåaktet hen. Radarer og satellitter oppdaget et ukjent objekt og helikoptre fløy umiddelbart til ulykkesstedet. Romvesenet trenger å rømme, han ønsker ikke å bli et objekt for eksperimentering. Hjelp ham å løpe raskt og behendig hoppe over kaktuser og andre hindringer, samle mynter. Fra tid til annen vil du bli fanget opp av et helikopter og skutt på med missiler i Alien Runner.