En morgen så innbyggerne i byen Metropolis hvordan en rekke romskip kom ned fra himmelen fra hvilke nykommere dukket opp. De åpnet umiddelbart brann på sivile og begynte å jakte på dem. Den modige helten som alltid har forsvart byen må igjen kjempe. Vi er i spillet Superman: Theme er Aliens vil hjelpe Superman å forsvare sin by og ødelegge motstandere. Vår helt må styres av radaren, som vil fortelle ham hvor de fremmede soldatene er. Etter det løper opp til dem må du angripe fienden. Du kan drepe dem med slag eller bruke superheltene til helten din.