I byen Zveropolis raser en epidemi, som bæres av luftbårne dråper. Kaninen Judith plukket opp infeksjonen og nå er halsen veldig sår. Etter å ha vært syk i flere dager og merket at hun ikke kommer til å bli bedre, bestemte hun seg for å gå på sykehuset. Du i spillet Judy's Throat Doctor vil være hennes behandlende lege. Det første du må gjøre er å undersøke Judiths hals og diagnostisere henne. Deretter begynner behandlingen med ulike medisinske apparater og medisiner. For å lette denne prosessen er det et hint i spillet som vil fortelle deg rekkefølgen og rekkefølgen av dine handlinger.