Mario og Pacman prøver å samle sopp som har vokst i den enorme tredimensjonale labyrinten til Mario Pacman 3D. Hver av disse kameratene begynner banen fra sin side av labyrinten. De er omgitt av murstein av forskjellige farger og gjenstander som må samles for å avsløre usynlige fantomer. Følg sammen bare fremover og vend til siden i tilfelle du ser et passasje til et nytt sted. På veien kommer du over spøkelser. Vær ekstremt forsiktig så du ikke løper inn i et gjeng med disse blodtørste monstrene. Kjør hodestengt i motsatt retning for å finne frelse fra dem.