Villain Fufelshmertts generere nye lumske ideer og en annen er allerede prøver å gjennomføre. I spillet Phineas og Ferb Bot thwack! du prøver å stoppe en gal vitenskapsmann, og vil hjelpe deg Perry Platypus i form av den allestedsnærværende Agent Pi. En ond lege ved hjelp av hans selskap Pakosting Inc. nashtampovat hel hær av roboter og sendte dem til Trishtate å stjele alle som irriterer ham og forstyrre hans planer for global fangst. Den første, som kom under grepet av stål Phineas, Ferb, Panda, og selv Kendes - bitchy søster. Perry har en spesiell fly som du klarer å angripe roboter. De vises ut av det blå portaler vil se deres aktivisering, fly dit og ta roboten til ombordstigning. Ta bort frigjort fanget om bord Phineas og Ferb Bot thwack!. Hjelpe Agent Pi, vil du spare Trishtate fra okkupasjonen Fufelshmerttsa og frustrere hans planer igjen. Du vil bli bedt behendighet, rask respons. Med jevne mellomrom vil skurken vike på enheten for å kontrollere situasjonen. Siden det er bedre å ikke bli involvert, skjule før den flyr bort med synlighet områder fortsetter frigjøringen oppdrag av spillet Phineas og Ferb Bot thwack!